[Caracterización de genomas recombinantes de la variante ómicron del SARS-CoV-2 entre el 2022 y el 2023 en el departamento de Antioquia, Colombia].

Authors

Cristian Arbey Velarde, Leila Cristina Vega, Idabely Betancur

Published in

Biomedica : revista del Instituto Nacional de Salud. Volume 46. Issue 2. Pages 228-245. Jun 01, 2026. Epub Jun 01, 2026.

Abstract

Introducción. La recombinación es un mecanismo que evita la acumulación de mutaciones nocivas. Para que se dé entre diferentes sublinajes de un mismo virus, se requiere cocirculación y coinfección en un mismo huésped. Mediante NGS (next-generation sequencing) se han podido caracterizar linajes recombinantes de la variante ómicron. Objetivo. Describir cómo la recombinación viral en linajes de ómicron le ha conferido características importantes para su prevalencia sobre otros linajes. Materiales y métodos. Se caracterizaron 338 genomas de linajes recombinantes de muestras positivas de SARS-CoV-2 analizadas por el Laboratorio Departamental de Salud Pública de Antioquia, entre el 9 de noviembre del 2022 y el 5 de noviembre del 2023. Los genomas fueron obtenidos mediante la tecnología de secuenciación de Oxford Nanopore™. Por medio de análisis filogenéticos se identificaron diferentes sublinajes recombinantes de ómicron. Predictores permitieron la identificación de regiones del genoma de SARS-CoV-2 que habían sido producto de eventos de recombinación. Resultados. Se identificaron 26 linajes recombinantes de ómicron en los que se encontraron cambios de aminoácidos de gran importancia, involucrados en la evasión de la respuesta inmunitaria, infectividad y replicación viral. También se identificó la mutación F456L, presente en el 55 % de los genomas de XBB.1.5.72, que sirve como biomarcador de reconocimiento de este sublinaje. Los análisis con predictores permitieron la identificación de los probables linajes parentales de algunos genomas recombinantes como XBB.1.5 y XBB.1.5.77. Conclusión. La circulación de sublinajes recombinantes de ómicron muestran cambios importantes que impactan la biología de estos y han alterado los factores de infección y virulencia.

PMID:
42378129
Bibliographic data and abstract were imported from PubMed on 01 Jul 2026.

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